Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEIL2Q969S2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms