Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms