Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2A3Q93084 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms