Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms