Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms