Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms