Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms