Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms