Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms