Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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