Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC9Q6ZRR7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms