Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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