Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms