Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms