Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms