Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB2Q5VUJ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB2Q5VUJ9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms