Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms