Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CC2D1BQ5T0F9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms