Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms