Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms