Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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SGCAQ16586 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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SGCAQ16586 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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SGCAQ16586 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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SGCAQ16586 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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SGCAQ16586 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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