Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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