Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSRP2Q16527 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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