Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRADDQ15628 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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