Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SURF2Q15527 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SURF2Q15527 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms