Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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