Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PRKD1Q15139 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKD1Q15139 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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PRKD1Q15139 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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