Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms