Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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