Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms