Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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