Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FAM53BQ14153 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53BQ14153 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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