Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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COL4A6Q14031 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL4A6Q14031 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms