Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms