Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAPSNQ13702 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms