Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNASE1L3Q13609 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms