Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP140Q13342 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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