Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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