Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD2Q13200 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms