Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms