Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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