Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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