Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms