Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEUP1Q05D60 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms