Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms