Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms