Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2C1P98194 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms