Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVPABLB-1P60509 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms