Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX9P55771 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms