Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
THOP1P52888 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
THOP1P52888 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms